Samostalnu trenersku karijeru započeo je 1995. u zagrebačkoj Doni odakle prelazi u Cibonu gdje ostaje dvije sezone. Bio je glavni trener turskog Tofaša, Splita, Cibone, Fortituda, Virtus Rome, Beneton. 2013. godine vodio je ekipu Cedevite iz Zagreba.  Nakon toga, Repeša je preuzeo ekipu Olimpije iz Milana, koju je vodio do juna 2017. Osim klubova, Repeša je vodio i Hrvatsku reprezentaciju.

Sada, sredinom 2018-2019. sezone Jasmin Repeša preuzima KK Budućnost VOLI.